Tháng 9 năm 1959, trường cấp III Sơn Tây ra đời đáp ứng nguyện vọng học tập của con em nhân dân các huyện Quốc Oai, Thạch Thất, Phúc Thọ, Ba Vì và thị xã Sơn Tây và một số huyện lân cận của tỉnh Phú Thọ. Năm đầu tiên thành lập, trường có 200 học sinh và 16 thầy cô giáo, mới chỉ có tên trường, chưa có lớp để học, phải học nhờ trường cấp II Phùng Hưng (ngày nay là Trường Trung học cơ sở Phùng Hưng). Cho tới 3 năm sau, năm 1962, trường mới có một cơ ngơi gồm 12 phòng học bên sông Tích và 1 dãy nhà ở, nhà làm việc, khu chăn nuôi và ruộng thí nghiệm. Trong thời kỳ giặc Mỹ leo thang phá hoại miền Bắc, thầy và trò đã phải đi sơ tán, đào hầm trú ẩn, làm lán trại, dựng lớp học ở các làng xã như Đồi Nhì - Tích Giang, Long Xuyên (Phúc Thọ), Trung Hưng và Đền Và để duy trì các lớp học.